Misi Organisasi Departemen Regional yaitu mendukung pelaksanaan tugas Anggota Dewan Gubernur yang membawahkan Kantor Perwakilan Bank Indonesia Dalam Negeri (KPwDN) melalui:
- operasionalisasi kebijakan utama Bank Indonesia di KPwDN;
- perencanaan, monitoring, evaluasi, dan peningkatan kinerja KPwDN;
- monitoring dan peningkatan governance KPwDN;
- pengelolaan sumber daya strategis KPwDN; dan
- koordinasi antar KPwDN Provinsi dengan Satuan Kerja mitra di Kantor Pusat.