Untuk meningkatkan pelayanan kepada pengunjung khususnya yang beragama Islam, Museum Bank Indonesia melengkapinya dengan fasilitas masjid yang tidak hanya dapat digunakan oleh pengunjung Museum tapi juga masyarakat sekitar. Masjid yang berlokasi di halaman belakang Museum Bank Indonesia diberi nama Masjid Baitul Iman, dan diresmikan pada tanggal 20 Januari 2012 oleh Gubernur Bank Indonesia, Darmin Nasution. Masjid ini merupakan masjid pertama di lingkungan Jakarta Kota Tua yang menempati area gedung museum. Sebelum pembangunan Masjid baru ini, terdapat musholla yang juga menempati areal halaman belakang yang dapat digunakan oleh pengunjung dan masyarakat sekitarnya untuk melakukan aktivitas keagamaan.
Mengawali peresmian, Direktur Direktorat Logistik dan Pengamanan memberikan laporan pembangunan Masjid. Mengawali persemian Masjid Gubernur BI memberikan sambutan singkat, yang dilanjutkan prasasti, dan diakhiri dengan pembacaan doa. Hadir dalam acara ini adalah para undangan yaitu : pejabat dari Direktorat Bank Indonesia, pensiunan Bank Indonesia, dan pengurus masjid.
Pada saat yang sama juga dilakukan pelepasan pegawai yang menjalani masa purna bakti tahun 2011 (sejumlah kurang lebih 70 orang pegawai), yang diselenggarakan di Auditorium Museum Bank Indonesia. Acara dimulai dengan laporan Direktur Direktorat Sumber Daya Manusia, dilanjutkan dengan serah terima pegawai purnabakti tahun 2011 dari Bank Indonesia ke Pensiunan Pegawai Bank Indonesia (PPBI), sambutan Ketua Umum PPBI, kesan dan pesan perwakilan pegawai purna bakti, dan Sambutan Gubernur Bank Indonesia. Penyerahan cinderamata dilakukan secara simbolis kepada perwakilan pegawai di gololongan/jabatan, diakhiri dengan doa.